Komplex Rendszerek és Mikrobiom-innovációk Központja

1.

Gashi, N., Mikolás, M., Dávid, P., Fauszt, P., Gál, F., Stündl, L., Gálné Remenyik, J., Paholcsek, M.: 35 years of soil health science: trends, gaps, and future directions.
In: International Conference on Science, Technology, Engineering and Economy: ICOSTEE 2026: Book of Abstracts. Ed.: József Sárosi, Zsuzsanna László, Réka Dobozi, Szegedi Egyetem, Műszaki Kar, Szeged, 20, 2026. ISBN: 9789636881306

DEA

2.

Fauszt, P., Szilágyi, E., Mikolás, M., Szilágyi-Tolnai, E., Dávid, P., Forgács, I. N., Csernus, B., Gál, F., Stündl, L., Biró, S., Szabó, C., Gálné Remenyik, J., Babinszky, L., Paholcsek, M.: Alleviation of heat stress-induced microbial dysbiosis in pigs through dietary supplementation with vitamins and trace elements.
anim microbiome. 8 (1), 1-25, (article identifier: 75), 2026.

doi DEA

Journal metrics:

Q1 Microbiology (medical) (2025)

D1 Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous) (2025)

D1 Veterinary (miscellaneous) (2025)

D1 Animal Science and Zoology (2025)

3.

Hasani, A., Zoto, O., Kulici, M., Gashi, N., Salihu, S.: An Exploratory Study of Honey Consumption Preferences: Insights from a Multi-Model Approach in Kosovo.
Foods. 15 (2), 1-25, (article identifier: 334), 2026.

doi DEA

Journal metrics:

Q1 Food Science (2025)

D1 Health Professions (miscellaneous) (2025)

Q1 Health (social science) (2025)

Q2 Microbiology (2025)

Q1 Plant Science (2025)

4.

Szőke, Z., Gashi, N., Dávid, P., Fauszt, P., Mikolás, M., Szilágyi-Tolnai, E., Szilágyi, E., Bíróné Molnár, P., Pesti-Asbóth, G., Homoki, J., Forgács, I. N., Gál, F., Stündl, L., Gálné Remenyik, J., Paholcsek, M.: Comparative Analysis of Gut Microbiome Composition and Blood Lipid Profiles in Intensively Reared Broiler Chickens and Ducks.
Animals (Basel). 16 (8), 1-24, (article identifier: 1240), 2026.

doi DEA

Journal metrics:

Q1 Animal Science and Zoology (2025)

D1 Veterinary (miscellaneous) (2025)

5.

Szendi, R., Szilágyi, E., Szarvas, M. M., Forgács, I. N., Homoki, J., Pesti-Asbóth, G., Szőllősi, E., Fazekas, M., Cziáky, Z., Lukács, J., Stündl, L., Szilágyi-Tolnai, E., Gálné Remenyik, J.: Deciphering the Role of Postbiotics Derived from Bacillus subtilis natto on LPS-Induced Endothelial Cell Dysfunction.
Biomedicines. 14 (2), 1-24, (article identifier: 293), 2026.

doi DEA

Journal metrics:

Q1 Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous) (2025)

Q1 Medicine (miscellaneous) (2025)

6.

Gashi, N., Fauszt, P., Dávid, P., Szőke, Z., Bíróné Molnár, P., Kun-Nemes, A., Szőllősi, E., Gál, F., Stündl, L., Zsombik, L., Gálné Remenyik, J., Paholcsek, M.: Engineering crop nutritional outcomes through soil microbiome modulation.
In: XXIX. Tavaszi Szél Konferencia 2026: Absztrakt kötet / Molnár Dániel, Molnár Dóra, DOSZ, Budapest, 47-48, 2026. ISBN: 9786156457967

DEA

7.

Gashi, N., Paholcsek, M.: Global Trends in Soil Science and Microbiome-Based Approaches for Soil Health Assessment.
In: The 15th ICONPO: International Conference on Public Organization (ICONPO) 2026: Bridging Technology, Green Energy, and Environmental Sustainability, PCIM Hongaria, Budapest, NA, PPI Hongaria 2026.

DEA

8.

Kokavecz, L., Sohajda, Z., Dávid, P., Stágel, A., Baróti-Tóth, K., Nagy, S., Paholcsek, M., Siposné Sohajda, R.: Incidence of parvovirus B19 among Hungarianblood donor population during COVID-19restrictions and the subsequent B19 epidemicof 2024.
Epidemiol. Infect. 154, 1-8, (article identifier: 11), 2026.

doi DEA WoS

Journal metrics:

Q2 Epidemiology (2025)

Q2 Infectious Diseases (2025)

9.

Gashi, N., Dávid, P., Szőke, Z., Fauszt, P., Dobos, A., Gálné Remenyik, J., Stündl, L., Paholcsek, M.: Insights into soil microbial diversity, community composition, and resistome profiles across agricultural systems.
In: International Conference on Science, Technology, Engineering and Economy: ICOSTEE 2026: Book of Abstracts. Ed.: József Sárosi, Zsuzsanna László, Réka Dobozi, Szegedi Egyetem, Műszaki Kar, Szeged, 19, 2026. ISBN: 9789636881306

DEA

10.

Gashi, N., Dávid, P., Mikolás, M., Fauszt, P., Gál, F., Rácz, C., Molnár, K., Stündl, L., Gálné Remenyik, J., Dobos, A., Paholcsek, M.: Land-Use and Depth-Dependent Assembly of Soil Microbiomes Shapes Ecological Functions, Interaction Networks, and Phytopathogenic Communities Across Crop and Orchard Systems.
Antioxidants. 15 (8), 1-39, (article identifier: 1017), 2026.

doi DEA

Journal metrics:

Q1 Biochemistry (2025)

Q1 Cell Biology (2025)

Q1 Clinical Biochemistry (2025)

D1 Food Science (2025)

Q1 Molecular Biology (2025)

Q1 Physiology (2025)

11.

Fauszt, P., Mikolás, M., Dávid, P., Szőke, Z., Gashi, N., Szilágyi-Tolnai, E., Szilágyi, E., Szarvas, M. M., Fazekas, M., Kun-Nemes, A., Stágel, A., Gál, F., Czeglédi, L., Biró, S., Stündl, L., Gálné Remenyik, J., Paholcsek, M.: Longitudinal source-sink dynamics of fecal litter and farm indoor environmental resistomes in broiler chicken and Cherry Valley ducks.
anim microbiome. 8 (1), 1-20, (article identifier: 45), 2026.

doi DEA WoS

Journal metrics:

Q1 Microbiology (medical) (2025)

D1 Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous) (2025)

D1 Veterinary (miscellaneous) (2025)

D1 Animal Science and Zoology (2025)

12.

Moubarak, M., Szilágyi-Tolnai, E., Barbulova, A., Fiume, I., Forgács, I. N., Homoki, J., Pesti-Asbóth, G., Szilágyi, E., Mammadova, R., Kisovec, M., Podobnik, M., Papp, D., Schlosser, G., Gálné Remenyik, J., Pócsfalvi, G.: Plant-derived nanovesicles from Ginkgo biloba seeds mitigate LPS-induced endothelial dysfunction and promote vascular homeostasis.
Front. Bioeng. Biotechnol. 13, 1-20, (article identifier: 1715489), 2026.

doi DEA

Journal metrics:

Q1 Bioengineering (2025)

Q1 Biomedical Engineering (2025)

Q1 Biotechnology (2025)

Q1 Histology (2025)

13.

Tóth, A. G., Paholcsek, M., Solymosi, N., Stágel, A., Gömbös, P., Posta, K., Lakatos, I., Nagy, S. Á., Ferenczi, S., Szőke, Z.: Protocol for the assessment of the impact of mycotoxins and glyphosate residues on the gut microbiome and resistome of European fallow deer.
STAR Protocols. 7 (2), 1-33, (article identifier: 104498), 2026.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

Q2 Immunology and Microbiology (miscellaneous) (2025)

Q2 Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous) (2025)

Q2 Neuroscience (miscellaneous) (2025)

14.

Gashi, N., Fauszt, P., Dávid, P., Szőke, Z., Bíróné Molnár, P., Kun-Nemes, A., Szőllősi, E., Gál, F., Stündl, L., Zsombik, L., Gálné Remenyik, J., Paholcsek, M.: Soil management-dependent shifts in microbial diversity and nutrient - related functions ultimately shape the nutritional composition of maize and wheat.
Plant Soil. [Epub ahead of print], 1-25, (article identifier: 08703), 2026.

doi DEA

Journal metrics:

D1 Plant Science (2025)

Q1 Soil Science (2025)

15.

Fauszt, P., Mikolás, M., Dávid, P., Szőke, Z., Gashi, N., Szilágyi-Tolnai, E., Szilágyi, E., Szarvas, M. M., Fazekas, M., Kun-Nemes, A., Gál, F., Stündl, L., Gálné Remenyik, J., Paholcsek, M.: Tracking antibiotic resistance in poultry farms and fecal litter.
In: International Conference on Science, Technology, Engineering and Economy: ICOSTEE 2026: Book of Abstracts. Ed.: József Sárosi, Zsuzsanna László, Réka Dobozi, Szegedi Egyetem, Műszaki Kar, Szeged, 17, 2026. ISBN: 9789636881306

DEA

16.

Gashi, N., Mikolás, M., Dávid, P., Fauszt, P., Gál, F., Stündl, L., Gálné Remenyik, J., Paholcsek, M.: Trends in Global Soil Research and a Microbiome-Based Framework for Soil Health Assessment.
Agronomy. 16 (12), 1-36, (article identifier: 1154), 2026.

doi DEA

Journal metrics:

Q1 Agronomy and Crop Science (2025)

17.

Mikolás, M., Fauszt, P., Petrilla, A., Németh, P., Dávid, P., Szilágyi-Tolnai, E., Szilágyi-Rácz, A. A., Stágel, A., Gál, F., Gál, K., Siposné Sohajda, R., Szőke, Z., Hossain, S. A., Stündl, L., Biró, S., Gálné Remenyik, J., Paholcsek, M.: Analysis of ICU resistome dynamics in patients, staff and environment for the identification of predictive biomarkers of sepsis and early mortality.
Sci Rep. 15 (1), 1-23, (article identifier: 25080), 2025.

doi DEA WoS

Journal metrics:

Q1 Multidisciplinary

18.

Gál, K., Dávid, P., Paholcsek, M., Barabás, M., Szilágyi, E., Balogh, K., Solymosi, D., Miklós, S., Mikáczó, J., Loós-Trási, K., Csiki, E., Simon, M., Fauszt, P., Póliska, S., Gálné Remenyik, J., Kovács, Á., Szilágyi-Tolnai, E.: Analysis of the Circulating miRNome Expression Profile in Saliva Samples After Neoadjuvant Chemoradiotherapy in a Rectal Cancer Study Population Using Next-Generation Sequencing.
Int. J. Mol. Sci. 26 (21), 1-22, (article identifier: 10506), 2025.

doi DEA

Journal metrics:

Q1 Catalysis

Q1 Computer Science Applications

D1 Inorganic Chemistry

Q1 Medicine (miscellaneous)

Q2 Molecular Biology

D1 Organic Chemistry

Q1 Physical and Theoretical Chemistry

D1 Spectroscopy

19.

Gashi, N., Elezaj, B., Qorri, D., Salihu, S.: Analyzing the health perceptions and consumption patterns of pre-cooked noodles.
In: The 6th International Electronic Conference on Foods Future Horizons in Foods and Sustainability

DEA

20.

Fazekas, M., Pesti-Asbóth, G., Bíróné Molnár, P., Nagy, A., Csótó, A., Stündl, L., Gálné Remenyik, J.: A redox homeosztázisban szerepet játszó gének viselkedése tannin kezelés hatására.
In: A Magyar Szabadgyök-Kutató Társaság XIII. Kongresszusa: Program és Összefoglalók. Szerk.: Máthé Csaba, Poór Péter, Blázovics Anna, Debreceni Egyetem, Debrecen, 13, 2025. ISBN: 9789634907367

DEA

21.

Fauszt, P., Mikolás, M., Dávid, P., Szőke, Z., Gashi, N., Szilágyi-Tolnai, E., Szarvas, M. M., Fazekas, M., Kun-Nemes, A., Gál, F., Stündl, L., Czeglédi, L., Stágel, A., Biró, S., Gálné Remenyik, J., Paholcsek, M.: A rezisztencia átvitele a környezet, illetve bél mikrobiom között az intenzív brojlercsirke és kacsa tenyésztésben.
In: XXVIII. Tavaszi Szél Konferencia 2025 : Absztrakt kötet. Szerk.: Molnár Dániel, Molnár Dóra, Doktoranduszok Országos Szövetsége, Budapest, 44, 2025. ISBN: 9786156457738

DEA

22.

Kun-Nemes, A., Farkas, D., Szilágyi-Tolnai, E., Fazekas, M., Paholcsek, M., Stündl, L., Bíróné Molnár, P., Cziáky, Z., Dobránszki, J., Gálné Remenyik, J.: Az exogén melatoninellátás hatásának vizsgálata in vitro burgonyanövényeken =: Examination of the effects of exogenous melatonin supply in potato plants in vitro.
In: A Magyar Szabadgyök-Kutató Társaság XIII. Kongresszusa: Program és Összefoglalók. Szerk.: Máthé Csaba, Poór Péter, Blázovics Anna, Debreceni Egyetem, Debrecen, 21-22, 2025. ISBN: 9789634907367

DEA

23.