MTA-DE Lendület Genom szerkezet és Rekombináció Kutatócsoport

1.

Xu, X., Penjweini, R., Székvölgyi, L., Karányi, Z., Heckel, A. M., Gurusamy, D., Szabóné, V. D., Yang, S., Brown, A. L., Cui, W., Park, J., Nagy, D., Podszun, M. C., Yang, S., Singh, K., Ashcroft, S. P., Kim, J., Kim, M. K., Tarassov, I., Zhu, J., Philp, A., Rotman, Y., Knutson, J. R., Entelis, N., Chung, J. H.: Endonuclease G promotes hepatic mitochondrial respiration by selectively increasing mitochondrial tRNA Thr production.
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 122 (1), 1-12, (article identifier: 2411298122), 2025.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

D1 Multidisciplinary (2024)

2.

Tóth, D. M., Szeri, F., Ashaber, M., Muazu, M., Székvölgyi, L., Arányi, T.: Tissue-specific roles of de novo DNA methyltransferases.
Epigenetics Chromatin. 18 (1), 1-16, (article identifier: 5), 2025.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

Q1 Genetics (2024)

Q1 Molecular Biology (2024)

3.

Székvölgyi, L.: Chromosomal R-loops: who R they?.
Biologia Futura. 3, 1-8, 2024.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

Q2 Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous)

Q3 Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous)

4.

Feró, O., Szabóné, V. D., Nagy, É., Karányi, Z., Sipos, É., Engelhardt, J., Török, N., Balogh, I., Vető, B., Liko, I., Fóthi, Á., Szabó, Z., Halmos, G., Vécsei, L., Arányi, T., Székvölgyi, L.: DNA methylome, R-loop and clinical exome profiling of patients with sporadic amyotrophic lateral sclerosis.
Sci Data. 11 (1), 1-12, (article identifier: 123), 2024.

doi DEA Scopus

Journal metrics:

D1 Computer Science Applications

D1 Education

D1 Information Systems

D1 Library and Information Sciences

D1 Statistics and Probability

D1 Statistics, Probability and Uncertainty

5.

Székvölgyi, L.: 70 éves a DNS dupla hélix; Watson, Crick és Rosalind Franklin kiemelkedő szerepe.
Biokémia. 47 (4), 44-46, 2023.

DEA

6.

Feró, O., Karányi, Z., Nagy, É., Mosolygó, Á., Szaker, H., Csorba, T., Székvölgyi, L.: Coding and noncoding transcriptomes of NODULIN HOMEOBOX (NDX)-deficient Arabidopsis inflorescence.
Sci Data. 10 (1), 1-12, (article identifier: 364), 2023.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

D1 Computer Science Applications

D1 Education

D1 Library and Information Sciences

D1 Information Systems

D1 Statistics and Probability

D1 Statistics, Probability and Uncertainty

7.

Karányi, Z., Mosolygó, Á., Feró, O., Horváth, A., Boros-Oláh, B., Nagy, É., Hetey, S., Holb, I., Szaker, H., Miskei, M., Csorba, T., Székvölgyi, L.: NODULIN HOMEOBOX is required for heterochromatin homeostasis in Arabidopsis.
Nat Comms. 13, 1-20, (article identifier: 5058), 2022.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

D1 Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous)

D1 Chemistry (miscellaneous)

D1 Physics and Astronomy (miscellaneous)

8.

Tóth, A., Székvölgyi, L., Vellai, T.: The genome loading model for the origin and maintenance of sex in eukaryotes.
Biol. Futur. 12, 1-20, 2022.

doi DEA Scopus

Journal metrics:

Q3 Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous)

Q2 Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous)

9.

Nagy, T., Csányi, E., Alnajjar, M., Fehér, P., Ninausz, N., Feró, O., Skage, M., Kollias, S., Fekete, Z., Kontra, L., Sándor, G., Heltai, M., Székvölgyi, L., Stéger, V., Barta, E.: The golden jackal (Canis aureus) reference genome assembly and annotation.
In: 3rd International Jackal Symposium 02-04. November 2022. Gödöllő, Hungary : Abstract Book. Ed.: Miklós Heltai, Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, Institute for Wildlife Management and Nature Conservation, Gödöllő, 61, 2022.

DEA

10.

Miskei, M., Horváth, A., Viola, L., Varga, L., Nagy, É., Feró, O., Karányi, Z., Roszik, J., Miskey, C., Ivics, Z., Székvölgyi, L.: Genome-wide mapping of binding sites of the transposase-derived SETMAR protein in the human genome.
Computational and Structural Biotechnology Journal. 19, 4032-4041, 2021.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

Q1 Biochemistry

D1 Biophysics

Q1 Biotechnology

Q1 Computer Science Applications

Q1 Genetics

Q2 Structural Biology

11.

Mustachio, L. M., Chelariu-Raicu, A., Székvölgyi, L., Roszik, J.: Targeting KRAS in Cancer: promising Therapeutic Strategies.
Cancers (Basel). 13 (6), 1-14, 2021.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

Q2 Cancer Research

Q1 Oncology

12.

Molnár-Fodor, K., Sipos, É., Dobos, N., Nagy, J., Steiber, Z., Méhes, G., Dull, K., Székvölgyi, L., Schally, A. V., Halmos, G.: Correlation between the Expression of Angiogenic Factors and Stem Cell Markers in Human Uveal Melanoma.
Life (Basel). 10 (12), 1-15, 2020.

doi DEA

Journal metrics:

Q2 Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous)

Q1 Ecology, Evolution, Behavior and Systematics

Q1 Paleontology

Q2 Space and Planetary Science

13.

Karányi, Z., Hornyák, L., Székvölgyi, L.: Histone H3 lysine 56 acetylation is required for formation of normal levels of meiotic DNA breaks in S. cerevisiae.
Front. Cell. Dev. Biol. 7, 1-18, 2020.

doi DEA

Journal metrics:

Q1 Developmental Biology

Q1 Cell Biology

14.

Boros-Oláh, B., Dobos, N., Hornyák, L., Szabó, Z., Karányi, Z., Halmos, G., Roszik, J., Székvölgyi, L.: Drugging the R-loop interactome: RNA-DNA hybrid binding proteins as targets for cancer therapy.
DNA Repair. 84, 1-10, 2019.

doi DEA Scopus

Journal metrics:

Q1 Biochemistry

Q1 Cell Biology

Q1 Molecular Biology

15.

Sipos, É., Dobos, N., Rózsa, D., Molnár-Fodor, K., Oláh, G., Szabó, Z., Székvölgyi, L., Schally, A. V., Halmos, G.: Characterization of Luteinizing hormone-releasing hormone (LH-RH-I) receptor type I as a potential molecular target in OCM-1 and OCM-3 human uveal melanoma cell lines.
OncoTargets Ther. 11, 933-941, 2018.

doi DEA

Journal metrics:

Q2 Oncology

Q2 Pharmacology (medical)

16.

Hegedűs, É., Kókai, E., Nánási, P. P. i., Imre, L., Halász, L., Jossé, R., Antunovics, Z., Webb, M. R., El Hage, A., Pommier, Y., Székvölgyi, L., Dombrádi, V., Szabó, G.: Endogenous single-strand DNA breaks at RNA polymerase II promoters in Saccharomyces cerevisiae.
Nucleic Acids Res. 46 (20), 10649-10668, 2018.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

D1 Genetics

17.

Karányi, Z., Halász, L., Acquaviva, L., Jonás, D., Hetey, S., Boros-Oláh, B., Peng, F., Chen, D., Klein, F., Géli, V., Székvölgyi, L.: Nuclear dynamics of the Set1C subunit Spp1 prepares meiotic recombination sites for break formation.
J. Cell Biol. 217 (10), 3398-3415, 2018.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

D1 Cell Biology

D1 Medicine (miscellaneous)

18.

Hornyák, L., Dobos, N., Koncz, G., Karányi, Z., Páll, D., Szabó, Z., Halmos, G., Székvölgyi, L.: The role of indoleamine-2,3-dioxygenase (IDO) in cancer development, diagnostics, and therapy.
Front. Immunol. 9 (151), 1-8, 2018.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

Q1 Immunology

Q1 Immunology and Allergy

19.

Mosolygó, Á., Székvölgyi, L.: Az AtNDX transzkripciós faktor és az R-hurkok kromoszómális topográfiája.
Biokémia. 41 (1), 34-44, 2017.

DEA

20.

Qin, Y., Ekmekcioglu, S., Forget, M. A., Székvölgyi, L., Hwu, P., Grimm, E. A., Jazaeri, A. A., Roszik, J.: Cervical cancer neoantigen landscape and immune activity is associated with HPV master regulators.
Front. Immunol. 8, 1-8, 2017.

doi DEA WoS Scopus

Journal metrics:

Q1 Immunology

D1 Immunology and Allergy

21.

Roszik, J., Fenyőfalvi, G., Halász, L., Karányi, Z., Székvölgyi, L.: In Silico Restriction Enzyme Digests To Minimize Mapping Bias In Genomic Sequencing.
Mol. Ther. Methods. Clin. Dev. 6, 66-67, 2017.

doi DEA

Journal metrics:

Q2 Genetics

Q2 Molecular Biology

Q2 Molecular Medicine

22.

Székvölgyi, L.: Ha törik, ha szakad: DNS és genomszerkezet-kutatás a Debreceni Egyetemen.
Debr. szle. 24 (1), 95-99, 2016.

DEA

MTA-DE Lendület Genom szerkezet és Rekombináció Kutatócsoport

Publication list