EN HU

Dániel Bence

Dániel Bence

Teljes publikációs lista

2025
1.
Kiss, M., Halász, L., Hadadi, É., Berger, W. K., Tzerpos, P., Póliska, S., Kancheva, D., Gabriel, A., Barthelmess, R. M., Debraekeleer, A., Brughmans, J., Elkrim, Y., Martens, L., Saeys, Y., Dániel, B., Czimmerer, Z., Laoui, D., Nagy, L., Van Ginderachter, J. A.: Epigenomic preconditioning of peripheral monocytes determines their transcriptional response to the tumor microenvironment.
Genome Med. 17 (1), 1-17, (cikkazonosító: 82), 2025.
Folyóirat-mutatók:
D1 Genetics (2024)
D1 Genetics (clinical) (2024)
D1 Molecular Biology (2024)
D1 Molecular Medicine (2024)
2023
2.
Dániel, B., Belk, J. A., Meier, S. L., Chen, A. Y., Sándor, K., Czimmerer, Z., Varga, Z., Bene, K., Buquicchio, F. A., Qi, Y., Kitano, H., Wheeler, J. R., Foster, D. S., Januszyk, M., Longaker, M. T., Chang, H. Y., Satpathy, A. T.: Macrophage inflammatory and regenerative response periodicity is programmed by cell cycle and chromatin state.
Mol. Cell. 83 (1), 121-138, 2023.
Folyóirat-mutatók:
D1 Cell Biology
D1 Molecular Biology
2022
3.
Patsalos, A., Halász, L., Medina-Serpas, M. A., Berger, W. K., Dániel, B., Tzerpos, P., Kiss, M., Nagy, G., Fischer, C., Simándi, Z., Varga, T., Nagy, L.: A growth factor-expressing macrophage subpopulation orchestrates regenerative inflammation via GDF-15.
J. Exp. Med. 219 (1), 1-38, (cikkazonosító: 20210420), 2022.
Folyóirat-mutatók:
D1 Immunology
D1 Immunology and Allergy
D1 Medicine (miscellaneous)
4.
Göczi, L., Csumita, M., Horváth, A., Nagy, G., Póliska, S., Pigni, M., Thelemann, C., Dániel, B., Mianesaz, H., Varga, T., Sen, K., Raghav, S. K., Schoggins, J. W., Nagy, L., Acha-Orbea, H., Meissner, F., Reith, W., Széles, L.: A Multi-Omics Approach Reveals Features That Permit Robust and Widespread Regulation of IFN-Inducible Antiviral Effectors.
J. Immun. 209 (10), 1930-1941, 2022.
Folyóirat-mutatók:
Q1 Immunology
Q1 Immunology and Allergy
5.
Czimmerer, Z., Halász, L., Dániel, B., Varga, Z., Bene, K., Domokos, A., Hoeksema, M., Shen, Z., Berger, W. K., Silye-Cseh, T., Jambrovics, K., Kolostyák, Z., Fenyvesi, F., Váradi, J., Póliska, S., Hajas, G., Szatmári, I., Glass, C. K., Bácsi, A., Nagy, L.: The epigenetic state of IL-4-polarized macrophages enables inflammatory cistromic expansion and extended synergistic response to TLR ligands.
Immunity. 55 (11), 2006-2026, 2022.
Folyóirat-mutatók:
D1 Immunology
D1 Immunology and Allergy
D1 Infectious Diseases
2020
6.
Dániel, B., Czimmerer, Z., Halász, L., Botó, P., Kolostyák, Z., Póliska, S., Berger, W. K., Tzerpos, P., Nagy, G., Horváth, A., Hajas, G., Silye-Cseh, T., Nagy, A., Sauer, S., Francois-Deleuze, J., Szatmári, I., Bácsi, A., Nagy, L.: The transcription factor EGR2 is the molecular linchpin connecting STAT6 activation to the late, stable epigenomic program of alternative macrophage polarization.
Genes Dev. 34 (21-22), 1474-1492, 2020.
Folyóirat-mutatók:
D1 Developmental Biology
D1 Genetics
7.
Nagy, G., Dániel, B., Cuaranta-Monroy, I., Nagy, L.: Unraveling the Hierarchy of cis and trans Factors That Determine the DNA Binding by Peroxisome Proliferator-Activated Receptor γ.
Mol. Cell. Biol. 40 (7), 1-20, (cikkazonosító: 00547), 2020.
Folyóirat-mutatók:
Q1 Cell Biology
Q1 Molecular Biology
2019
8.
Moreira, T. G., Horta, L. S., Gomes-Santos, A. C., Oliveira, R. P., Queiroz, N. M. G. P., Mangani, D., Dániel, B., Vieira, A. T., Liu, S., Rodrigues, A. M., Gomes, D. A., Gabriely, G., Ferreira, E., Weiner, H. L., Rezende, R. M., Nagy, L., Faria, A. M. C.: CLA-supplemented diet accelerates experimental colorectal cancer by inducing TGF-β-producing macrophages and T cells.
Mucosal Immunol. 12 (1), 188-199, 2019.
Folyóirat-mutatók:
D1 Immunology
D1 Immunology and Allergy
9.
Horváth, A., Dániel, B., Széles, L., Cuaranta-Monroy, I., Czimmerer, Z., Ozgyin, L., Steiner, L., Kiss, M., Simándi, Z., Póliska, S., Giannakis, N., Raineri, E., Gut, I. G., Nagy, B., Nagy, L.: Labelled regulatory elements are pervasive features of the macrophage genome and are dynamically utilized by classical and alternative polarization signals.
Nucleic Acids Res. 47 (6), 2778-2792, 2019.
Folyóirat-mutatók:
D1 Genetics
2018
10.
Czimmerer, Z., Horváth, A., Dániel, B., Nagy, G., Cuaranta-Monroy, I., Kiss, M., Kolostyák, Z., Póliska, S., Steiner, L., Giannakis, N., Varga, T., Nagy, L.: Dynamic transcriptional control of macrophage miRNA signature via inflammation responsive enhancers revealed using a combination of next generation sequencing-based approaches.
Biochim. Biophys. Acta. Gene Regul. Mech. 1861 (1), 14-28, 2018.
Folyóirat-mutatók:
D1 Biochemistry
D1 Biophysics
Q1 Genetics
Q1 Molecular Biology
Q1 Structural Biology
11.
Czimmerer, Z., Nagy, Z. S., Nagy, G., Horváth, A., Silye-Cseh, T., Kriston, Á., Jonás, D., Sauer, S., Steiner, L., Dániel, B., Deleuze, J. F., Nagy, L.: Extensive and functional overlap of the STAT6 and RXR cistromes in the active enhancer repertoire of human CD14+ monocyte derived differentiating macrophages.
Mol. Cell. Endocrinol. 471, 63-74, 2018.
Folyóirat-mutatók:
Q1 Biochemistry
Q1 Endocrinology
Q2 Molecular Biology
12.
Dániel, B., Nagy, G., Horváth, A., Czimmerer, Z., Cuaranta-Monroy, I., Póliska, S., Hays, T. T., Sauer, S., Francois-Deleuze, J., Nagy, L.: The IL-4/STAT6/PPAR[gamma] signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages.
Nucleic Acids Res. 46 (9), 4425-4439, 2018.
Folyóirat-mutatók:
D1 Genetics
13.
Dániel, B., Nagy, G., Czimmerer, Z., Horváth, A., Hammers, D. W., Cuaranta-Monroy, I., Póliska, S., Tzerpos, P., Kolostyák, Z., Hays, T. T., Patsalos, A., Houtman, R., Sauer, S., Francois-Deleuze, J., Rastinejad, F., Bálint, B. L., Sweeney, H. L., Nagy, L.: The Nuclear Receptor PPAR[gamma] Controls Progressive Macrophage Polarization as a Ligand-Insensitive Epigenomic Ratchet of Transcriptional Memory.
Immunity. 49 (4), 615-626, 2018.
Folyóirat-mutatók:
D1 Immunology
D1 Immunology and Allergy
D1 Infectious Diseases
14.
Czimmerer, Z., Dániel, B., Horváth, A., Rückerl, D., Nagy, G., Kiss, M., Peloquin, M., Budai, M. M., Cuaranta-Monroy, I., Simándi, Z., Steiner, L., Nagy, B. J., Póliska, S., Bankó, C., Bacsó, Z., Schulman, I. G., Sauer, S., Deleuze, J. F., Allen, J. E., Benkő, S., Nagy, L.: The Transcription Factor STAT6 Mediates Direct Repression of Inflammatory Enhancers and Limits Activation of Alternatively Polarized Macrophages.
Immunity. 48 (1), 75-90, 2018.
Folyóirat-mutatók:
D1 Immunology
D1 Immunology and Allergy
D1 Infectious Diseases
2017
15.
Kiss, M., Czimmerer, Z., Nagy, G., Bieniasz-Krzywiec, P., Ehling, M., Pap, A., Póliska, S., Botó, P., Tzerpos, P., Horváth, A., Kolostyák, Z., Dániel, B., Szatmári, I., Mazzone, M., Nagy, L.: Retinoid X receptor suppresses a metastasis-promoting transcriptional program in myeloid cells via a ligand-insensitive mechanism.
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 114 (40), 10725-10730, 2017.
Folyóirat-mutatók:
D1 Multidisciplinary
2016
16.
Varga, T., Mounier, R., Patsalos, A., Gogolák, P., Peloquin, M., Horváth, A., Pap, A., Dániel, B., Nagy, G., Pintye, É., Póliska, S., Cuvellier, S., Ben Larbi, S., Sansbury, B. E., Spite, M., Brown, C. W., Chazaud, B., Nagy, L.: Macrophage PPAR[gamma], a Lipid Activated Transcription Factor Controls the Growth Factor GDF3 and Skeletal Muscle Regeneration.
Immunity. 45 (5), 1038-1051, 2016.
Folyóirat-mutatók:
D1 Immunology
D1 Immunology and Allergy
D1 Infectious Diseases
17.
Roqueta-Rivera, M., Esquejo, R. M., Phelan, P. E., Sándor, K., Dániel, B., Foufelle, F., Ding, J., Li, X., Khorasanizadeh, S., Osborne, T. F.: SETDB2 Links Glucocorticoid to Lipid Metabolism through Insig2a Regulation.
Cell Metab. 24 (3), 474-484, 2016.
Folyóirat-mutatók:
D1 Cell Biology
D1 Molecular Biology
D1 Physiology
18.
Czimmerer, Z., Varga, T., Kiss, M., Vázquez, C. O., Doan-Xuan, Q. M., Rückerl, D., Tattikota, S. G., Yan, X., Nagy, Z. S., Dániel, B., Póliska, S., Horváth, A., Nagy, G., Varallyay, É., Poy, M. N., Allen, J. E., Bacsó, Z., Abreu-Goodger, C., Nagy, L.: The IL-4/STAT6 signaling axis establishes a conserved microRNA signature in human and mouse macrophages regulating cell survival via miR-342-3p.
Genome Med. 8 (1), 1-22, 2016.
Folyóirat-mutatók:
D1 Genetics
D1 Genetics (clinical)
D1 Molecular Biology
D1 Molecular Medicine
19.
Sándor, K., Dániel, B., Kiss, B., Kovács, F., Szondy, Z.: Transcriptional control of transglutaminase 2 expression in mouse apoptotic thymocytes.
Biochim. Biophys. Acta. Gene Regul. Mech. 1859 (8), 964-974, 2016.
Folyóirat-mutatók:
D1 Biochemistry
D1 Biophysics
D1 Genetics
D1 Molecular Biology
Q1 Structural Biology
2014
20.
Brázda, P., Krieger, J. W., Dániel, B., Jonás, D., Szekeres, T., Langowski, J., Tóth, K. Á., Nagy, L., Vámosi, G.: Ligand binding shifts highly mobile RXR to chromatin-bound state in a coactivator-dependent manner as revealed by single cell imaging.
Mol. Cell. Biol. 34 (7), 1234-1245, 2014.
Folyóirat-mutatók:
D1 Cell Biology
D1 Molecular Biology
21.
Dániel, B., Bálint, B. L., Nagy, Z., Nagy, L.: Mapping the genomic binding sites of the activated retinoid x receptor in murine bone marrow-derived macrophages using chromatin immunoprecipitation sequencing.
Methods. Mol. Biol. 1204, 15-24, 2014.
Folyóirat-mutatók:
Q3 Genetics
Q3 Molecular Biology
22.
Dániel, B., Nagy, G., Hah, N., Horváth, A., Czimmerer, Z., Póliska, S., Gyuris, T., Keirsse, J., Gysemans, C., Van Ginderachter, J. A., Bálint, B. L., Evans, R. M., Barta, E., Nagy, L.: The active enhancer network operated by liganded RXR supports angiogenic activity in macrophages.
Genes Dev. 28 (14), 1562-1577, 2014.
Folyóirat-mutatók:
D1 Developmental Biology
D1 Genetics
23.
Dániel, B., Nagy, G., Nagy, L.: The intriguing complexities of mammalian gene regulation: how to link enhancers to regulated genes. Are we there yet?.
FEBS Lett. 588 (15), 2379-2391, 2014.
Folyóirat-mutatók:
Q1 Biochemistry
D1 Biophysics
Q2 Cell Biology
Q1 Genetics
Q2 Molecular Biology
Q2 Structural Biology
2013
24.
Nagy, G., Dániel, B., Jonás, D., Nagy, L., Barta, E.: A novel method to predict regulatory regions based on histone mark landscapes in macrophages.
Immunobiology. 218 (11), 1416-1427, 2013.
Folyóirat-mutatók:
Q1 Hematology
Q2 Immunology
Q1 Immunology and Allergy
25.
Brignull, L. M., Czimmerer, Z., Saidi, H., Dániel, B., Villela, I., Bartlett, N. W., Johnston, S. L., Meira, L. B., Nagy, L., Nohturfft, A.: Reprogramming of lysosomal gene expression by interleukin-4 and Stat6.
BMC Genomics. 14 (1), 1-20, 2013.
Folyóirat-mutatók:
D1 Biotechnology
Q1 Genetics
DEENK Debreceni Egyetem
© 2012 Debreceni Egyetem