EN HU

Hoffka Gyula

Hoffka Gyula
Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet
Tudományos segédmunkatárs 2021-

Teljes publikációs lista

2025
1.
Hoffka, G.: A venezuelai ló-láz encephalitis vírus cisztein proteázának szerkezet-alapú vizsgálata.
Biokémia. 49 (2), 26-33, 2025.
2.
Listov, D., Vos, E., Hoffka, G., Hoch, S. Y., Berg, A., Hamer-Rogotner, S., Dym, O., Kamerlin, S. C. L., Fleishman, S. J.: Complete computational design of high-efficiency Kemp elimination enzymes.
Nature. 643 (8074), 1421-1427, 2025.
Folyóirat-mutatók:
D1 Multidisciplinary (2024)
3.
Gutierrez-Rus, L. I., Vos, E., Pantoja-Uceda, D., Hoffka, G., Gutierrez-Cardenas, J., Ortega-Munoz, M., Risso, V. A., Jimenez, M. A., Kamerlin, S. C. L., Sanchez-Ruiz, J. M.: Enzyme Enhancement Through Computational Stability Design Targeting NMR-Determined Catalytic Hotspots.
J. Am. Chem. Soc. 147 (18), 14978-14996, 2025.
Folyóirat-mutatók:
D1 Biochemistry (2024)
D1 Catalysis (2024)
D1 Chemistry (miscellaneous) (2024)
D1 Colloid and Surface Chemistry (2024)
4.
van der Pol, E., Schlatzer, T., Hoffka, G., Di Geronimo, B., Eder, J., Schweiger, A. K., Karava, M., Gross, D., Fischer, R. C., Kracher, D., Kazlauskas, R., Miyamoto, K., Kamerlin, S. C. L., Breinbauer, R., Kourist, R.: Mechanistic Elucidation and Stereochemical Consequences of Alternative Binding of Alkenyl Substrates by Engineered Arylmalonate Decarboxylase.
J. Am. Chem. Soc. 147 (43), 39271-39283, 2025.
Folyóirat-mutatók:
D1 Biochemistry (2024)
D1 Catalysis (2024)
D1 Chemistry (miscellaneous) (2024)
D1 Colloid and Surface Chemistry (2024)
5.
Hoffka, G., Hornyák, L., Székvölgyi, L., Miskei, M.: Phosphorylation of ITIM motifs drives the structural transition of indoleamine 2,3-dioxygenase 1 between enzymatic and non-enzymatic states.
Protein Sci. 34 (6), 1-13, 2025.
Folyóirat-mutatók:
D1 Biochemistry (2024)
D1 Medicine (miscellaneous) (2024)
D1 Molecular Biology (2024)
6.
Mahdi, M., Kiarie, I. W., Mótyán, J. A., Hoffka, G., Al-Muffti, A. S., Tóth, A., Tőzsér, J.: Receptor Binding for the Entry Mechanisms of SARS-CoV-2: Insights from the Original Strain and Emerging Variants.
Viruses-Basel. 17 (5), 1-25, (cikkazonosító: 691), 2025.
Folyóirat-mutatók:
Q1 Infectious Diseases (2024)
Q1 Virology (2024)
2024
7.
Kiarie, I. W., Hoffka, G., Laporte, M., Leyssen, P., Neyts, J., Tőzsér, J., Mahdi, M.: Efficacy of Integrase Strand Transfer Inhibitors and the Capsid Inhibitor Lenacapavir against HIV-2, and Exploring the Effect of Raltegravir on the Activity of SARS-CoV-2.
Viruses-Basel. 16 (10), 1-15, (cikkazonosító: 1607), 2024.
Folyóirat-mutatók:
Q1 Infectious Diseases
Q1 Virology
8.
Hoffka, G., Mhana, S., Vas, M., Toldi, V., Mótyán, J. A., Tőzsér, J., Szabó, A.: Modeling protease-sensitive human pancreatic lipase mutations in the mouse ortholog.
J. Biol. Chem. 300 (10), 1-13, (cikkazonosító: 107763), 2024.
Folyóirat-mutatók:
Q1 Biochemistry
Q1 Cell Biology
Q1 Molecular Biology
9.
Golda, M., Hoffka, G., Cherry, S., Tropea, J. E., Lountos, G. T., Waugh, D. S., Wlodawer, A., Tőzsér, J., Mótyán, J. A.: P1' specificity of the S219V/R203G mutant tobacco etch virus protease.
Proteins. 92 (9), 1085-1096, 2024.
Folyóirat-mutatók:
Q1 Biochemistry
Q2 Molecular Biology
Q2 Structural Biology
2023
10.
Hoffka, G., Lountos, G. T., Needle, D., Wlodawer, A., Waugh, D. S., Tőzsér, J., Mótyán, J. A.: Self-inhibited state of Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV) nsP2 cysteine protease: a crystallographic and molecular dynamics analysis.
J. Mol. Biol. 435 (6), 1-20, 2023.
Folyóirat-mutatók:
D1 Biophysics
Q1 Molecular Biology
Q1 Structural Biology
2022
11.
Mótyán, J. A., Mahdi, M., Hoffka, G., Tőzsér, J.: Potential Resistance of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) against Protease Inhibitors: lessons Learned from HIV-1 Protease.
Int. J. Mol. Sci. 23 (7), 1-20, (cikkazonosító: 3507), 2022.
Folyóirat-mutatók:
Q2 Catalysis
Q1 Computer Science Applications
D1 Inorganic Chemistry
Q1 Medicine (miscellaneous)
Q2 Molecular Biology
Q1 Organic Chemistry
Q1 Physical and Theoretical Chemistry
D1 Spectroscopy
2020
12.
Ambrus, V. A., Hoffka, G., Fuxreiter, M.: Asymmetric dynamic coupling promotes alternative evolutionary pathways in an enzyme dimer.
Sci. Rep. 10 (1), 1-9, (cikkazonosító: 18866), 2020.
Folyóirat-mutatók:
D1 Multidisciplinary
13.
Bozóki, B., Mótyán, J. A., Hoffka, G., Waugh, D. S., Tőzsér, J.: Specificity Studies of the Venezuelan Equine Encephalitis Virus Non-Structural Protein 2 Protease Using Recombinant Fluorescent Substrates.
Int. J. Mol. Sci. 21 (20), 1-26, (cikkazonosító: 7686), 2020.
Folyóirat-mutatók:
Q2 Catalysis
D1 Computer Science Applications
D1 Inorganic Chemistry
Q1 Medicine (miscellaneous)
Q2 Molecular Biology
D1 Organic Chemistry
D1 Physical and Theoretical Chemistry
D1 Spectroscopy
2019
14.
Tüű-Szabó, B., Hoffka, G., Duró, N., Fuxreiter, M.: Altered dynamics may drift pathological fibrillization in membraneless organelles.
Biochim. Biophys. Acta. Proteins Proteom. 1867 (10), 988-998, 2019.
Folyóirat-mutatók:
Q1 Analytical Chemistry
Q2 Biochemistry
Q1 Biophysics
Q2 Molecular Biology
15.
Ferenczi, R., Illyés, T. Z., Király, S. B., Hoffka, G., Szilágyi, L., Mándi, A., Antus, S., Kurtán, T.: Evaluation of Different Synthetic Routes to (2R,3R)-3-Hydroxymethyl-2-(4-hydroxy- 3-methoxyphenyl)-1,4-Benzodioxane-6-Carbaldehyde.
Curr. Org. Chem. 23 (26), 2960-2968, 2019.
Folyóirat-mutatók:
Q3 Organic Chemistry
DEENK Debreceni Egyetem
© 2012 Debreceni Egyetem